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Sci Rep:使用生物信息学鉴定骨关节炎中与滑膜炎相关的通路和基因

作者:xiangting 来源:MedSci梅斯 日期:2018-07-09
导读

         Sci Rep:使用生物信息学鉴定骨关节炎中与滑膜炎相关的通路和基因

关键字:  骨关节炎 |  | 生物信息学 |  | 滑膜炎 |  | PSMG3 |  |  

        骨关节炎(OA)中的滑膜炎是一种很常见的疾病。但其潜在机制仍未被很好了解。这项研究旨在探讨OA中滑膜炎的分子机制。

        基因表达谱GSE82107(从基因表达综合数据库中下载)包括OA患者的10个滑膜组织和健康人的7个滑膜组织。随后,使用生物技术信息的基因云(GCBI)进行差异表达基因(DEG)分析、GO(基因本体)富集分析、通路分析、通路网络分析和基因信号网络分析。确定了由1,471个上调基因和470个下调基因组成的1,941个DEGs。在OA滑膜炎中,PSMG3、LRP12 MIA-RAB4B、ETHE1、SFXN1、DAZAP1、RABEP2和C9orf16基因被显著调节。特别的是,MAPK信号通路、细胞凋亡和癌症中的通路在通路网络中起最重要作用。还分析了这些通路之间的关联。NRAS、SPHK2、FOS、CXCR4、PLD1、GNAI2和PLA2G4F等基因与OA滑膜炎密切相关。

        总之,这项研究表明,几种分子机制与OA滑膜炎的发生发展有关,这提高了人们对OA的理解,并为未来的治疗进展提供了分子靶点。

        原始出处:

        Hui Huang, et al.Identification of pathways and genes associated with synovitis in osteoarthritis using bioinformatics analyses.Sci Rep. 03 July 2018.

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